До недавнего времени управление студенческими спутниками "Аист-1" осуществлялось специалистами АО "РКЦ "Прогресс" в центре приема и обработки информации (ЦПОИ) "Самара". Данные, полученные с научной аппаратуры СГАУ, находящейся на борту спутников "Аист-1", обрабатывали инженеры ракетно-космического центра и затем передавали ученым университета.

С августа 2015 г. РКЦ "Прогресс" полностью передал управление аппаратами "Аист-1" Самарскому государственному аэрокосмическому университету. Теперь следить за спутниками, а также подавать команды на борт и снимать контрольную телеметрию будут ученые и аспиранты СГАУ.

Это стало возможным благодаря открытию в университете Наземного комплекса управления малыми космическими аппаратами (НКУ МКА СГАУ). Комплекс включает передатчик, приемник, четыре автоматизированных рабочих места и антенное устройство, расположенное на крыше научного корпуса СГАУ. Для работы в Наземном комплексе управления малыми космическими аппаратами аспиранты СГАУ предварительно прошли обучение и аттестацию в РКЦ "Прогресс".

С помощью Наземного комплекса управления молодые ученые смогут самостоятельно формировать программу полета спутника и закладывать ее на борт, включать в заданное время ту или иную научную аппаратуру, получать информацию о параметрах движения, температурных показателях, напряжении бортовой сети и токе солнечных панелей, а также проводить ряд других операций.

В настоящее время Наземный комплекс управления малыми космическими аппаратами перешел в режим штатного дежурства и проводит пять сеансов связи со спутниками "Аист" в сутки, каждый сеанс длится от 1 до 12 минут. Частота и длительность сеансов связи зависит от нахождения космических аппаратов относительно зоны радиовидимости антенн Наземного комплекса управления.

По мнению начальника научно-образовательного комплекса малых космических аппаратов СГАУ профессора Сергея Ткаченко, возможность участвовать в управлении малыми космическими аппаратами позволит привлечь студентов и аспирантов к научным исследованиям с использованием спутников "Аист-1".

Также передача управления спутниками "Аист-1" в СГАУ освободит технические возможности ЦПОИ "Самара" для подготовки к работе с космическим аппаратом "Аист-2", который создается РКЦ "Прогресс" совместно с Самарским государственным аэрокосмическим университетом и будет выведен на орбиту в рамках первой пусковой кампании с космодрома Восточный.